Za neodoslanie požadovaných údajov z vystavených alebo prijatých e-faktúr, ich oneskorené odoslanie alebo uvedenie neúplných či nesprávnych údajov môže Finančná správa uložiť pokutu až do výšky 10 000 €.

Pri opakovanom porušení môže pokuta dosiahnuť až 100 000 €. Pri určovaní jej výšky Finančná správa zohľadní závažnosť porušenia a dĺžku jeho trvania.

Pokuta sa neuloží, ak zrejmý omyl bezodkladne opravíte. Rovnako sa neuplatní, ak oznamovacia povinnosť nebola splnená pre preukázateľnú technickú poruchu na strane certifikovaného poskytovateľa doručovacej služby a údaje boli odoslané ihneď po jej odstránení.